蛋白质是“生肌造肉”的基础，它是生命存在的形式，没有蛋白质就没有生命。婴幼儿是生长发育较迅速的时期，对蛋白质的量和质均要比成人时期高许多。
乳清蛋白中含有高浓度、比例恰当的必需氨基酸，还含有为新生儿必需的半胱氨酸。此外，乳清蛋白还含有包括免疫球蛋白和双歧因子等免疫因子。对于宝宝而言，乳清蛋白是一种优质蛋白，因为它容易被消化，蛋白质的生物利用度高，从而有效减轻肾脏负担。
酪蛋白中含有丰富的必需氨基酸，还含有婴儿特别需求的蛋氨酸、苯丙氨酸及酪氨酸。另外，酪蛋白中结合了重要的矿物元素，如钙、磷、铁、锌等。但是，酪蛋白是一种大型、坚硬、致密、极困难消化分解的凝乳。过量的酪蛋白会产生较高的肾溶质负荷，给宝宝肾脏带来较重的负担，对宝宝是不安全的。
母乳中乳清蛋白和酪蛋白的比例为60 : 40
乳清蛋白和酪蛋白各有好处，但合适的比例还是应该以母乳作为黄金标准。母乳中乳清蛋白和酪蛋白的比例为60 : 40（而普通牛奶中乳清蛋白和酪蛋白的比例为18 : 82）。
各种品牌的婴儿奶粉都在宣称“接近母乳”，其中乳清蛋白和酪蛋白的比例是一个重要的指标，因为它能提供最接近母乳的氨基酸组合，更好地满足宝宝的成长需要。
根据2011年4月1日实施的《食品安全国家标准婴儿配方食品》规定，乳基婴儿配方食品中乳清蛋白含量应大于等于60%。
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